Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Foxd2O35392 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxd2O35392 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxd2O35392 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms