Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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