Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Gm21887J3QQ04 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms