Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34c2J3QNM1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms