Protein–RNA interactions for Protein: J3KMT3

Gm6882, Predicted gene 6882, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6882J3KMT3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6882J3KMT3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6882J3KMT3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms