Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r67G5E8C1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms