Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zfp988F6VKC7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zfp988F6VKC7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp988F6VKC7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Zfp988F6VKC7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zfp988F6VKC7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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