Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
2610021A01RikE9Q0Q3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms