Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdr1E9Q0B4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdr1E9Q0B4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms