Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde2E9PUP1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde2E9PUP1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms