Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim12cD3Z3L3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim12cD3Z3L3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12cD3Z3L3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12cD3Z3L3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12cD3Z3L3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim12cD3Z3L3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms