Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17333C6EQI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms