Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rrn3B2RS91 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rrn3B2RS91 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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