Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm438B1ASB3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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