Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp36B1AQJ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp36B1AQJ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms