Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r2A2AMT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r2A2AMT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms