Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A0A0U1RNP2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A0A0U1RNP2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms