Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms