Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hps1O08983 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hps1O08983 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Parp11-204ENSMUST00000112195 733 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Med6-204ENSMUST00000161211 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hps1O08983 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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