Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Zmynd8-201ENSMUST00000018050 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Ccdc180J3QNE4 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc180J3QNE4 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc180J3QNE4 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Ccdc180J3QNE4 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Aldh7a1-208ENSMUST00000174518 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc180J3QNE4 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc180J3QNE4 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Nfatc1-201ENSMUST00000035800 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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