Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Krt27Q9Z320 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt27Q9Z320 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt27Q9Z320 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt27Q9Z320 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Krt27Q9Z320 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt27Q9Z320 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms