Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gipc2Q9Z2H7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gipc2Q9Z2H7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms