Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn7Q9Z261 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn7Q9Z261 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms