Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stk39Q9Z1W9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stk39Q9Z1W9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stk39Q9Z1W9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms