Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ddx39bQ9Z1N5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms