Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp4Q9WV89 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stxbp4Q9WV89 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms