Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Npas3Q9QZQ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Npas3Q9QZQ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms