Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ndrg3Q9QYF9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ndrg3Q9QYF9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms