Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnip3Q9QXT8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Kcnip3Q9QXT8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnip3Q9QXT8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnip3Q9QXT8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Kcnip3Q9QXT8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kcnip3Q9QXT8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kcnip3Q9QXT8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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