Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt17Q9QWL7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt17Q9QWL7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms