Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dkk3Q9QUN9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dkk3Q9QUN9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms