Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoaQ9QUI0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoaQ9QUI0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoaQ9QUI0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoaQ9QUI0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoaQ9QUI0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoaQ9QUI0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoaQ9QUI0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms