Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pkd2l2Q9JLG4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms