Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Riox1Q9JJF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms