Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smad9Q9JIW5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smad9Q9JIW5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms