Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1fQ9JIS7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1fQ9JIS7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms