Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pus3Q9JI38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pus3Q9JI38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pus3Q9JI38 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms