Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd8Q9DA37 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms