Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmco5aQ9D9D5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmco5aQ9D9D5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms