Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arpc5lQ9D898 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Arpc5lQ9D898 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms