Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fip1l1Q9D824 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fip1l1Q9D824 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms