Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PudpQ9D5U5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms