Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stag1Q9D3E6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stag1Q9D3E6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stag1Q9D3E6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms