Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssbp3Q9D032 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms