Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mrps28Q9CY16 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrps28Q9CY16 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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