Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ergic3Q9CQE7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms