Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab5aQ9CQD1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab5aQ9CQD1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rab5aQ9CQD1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab5aQ9CQD1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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