Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700029P11RikQ9CQ68 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms