Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp3Q9CQ10 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chmp3Q9CQ10 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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