Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc24a3Q99PD7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc24a3Q99PD7 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms